结直肠癌研究取得进展

最近来自美国Dana-Farber癌症研究所（Dana-FarberCancerInstitute）、哈佛医学院，布洛德研究所（BroadInstitute）、以色列魏兹曼科学等地的研究人员对结直肠癌样本进行了全基因组测序分析，发现了与结直肠癌相关的新基因融合。新的研究发现，它为进一步了解结直肠癌的发展机制提供了新的线索。相关论文于9月4日发表（NatureGenetics）杂志上。结直肠癌（ColorectalCancer）结肠癌和直肠癌的总称是胃肠道最常见的恶性疾病之一，仅次于胃癌和食管癌。大约一半的患者在接受传统切除术后会转移或扩散癌细胞，一旦转移或扩散，5年的存活率只有8%。在本文中，研究人员使用它IlluminaGAII的测序平台对9例大肠癌组织及匹配的正常组织进行了全基因组测序分析，其测序深度分别达到30.7倍和31.9根据基因组分析结果，研究人员发现了137，968个潜在的体细胞突变，其中的712个有可能导致了蛋白质编码序列碱基错义替换（non-synonymoussubstitution）、插入或缺失。研究人员使用质谱基因分类法检测到521个缺失突变，证实其中439个是真正的体细胞突变。根据基因组分析的结果，研究人员推测每个结直肠癌基因组约为10-6每个序列包含5个突变，其中基因间序列约为每个10-6个序列包含6.7内容子序列约为每个突变10-6个序列包含4.8外显子序列约为每个突变10-6个序列包含4.2一个突变。此外，研究人员还粗略计算出，在外显子序列中，大约每次10-6包含序列3.1一个错误的突变。研究人员指出，与过去的研究一致，他们发现突变主要集中在基因组CpG位点。在随后的研究人员筛查另一组97个结肠癌样本时，在3个癌症样本中发现了新的基因融合VTI1A-TCF7L2。癌症中的染色体重排列通常会导致两个独立的基因融合。在某些情况下，两个基因编码区域连接在一起，导致蛋白质融合的表达。有时基因重排会导致一个基因在另一个基因的控制元件下，从而导致异常的基因表达。基因融合与白血病、淋巴瘤等多种血液、骨髓和软组织癌有关。近年来，一些研究发现，胃癌和癌症等一些实体瘤也存在基因融合。我们在三个结直肠癌样本中发现了高通量的基因组测序技术VTI1A-TCF7L2文章的共同沟通作者，同时在美国工作，证实它在大肠癌的发生中起着重要的活性作用Dana-Farber癌症研究所、哈佛医学院和布洛德研究所的病理学研究员MatthewMeyerson说。新研究首次揭示了与结直肠癌相关的基因融合，发现它可能有助于医生更有效地进行临床治疗，并促进研究人员开发新的治疗药物和结直肠癌诊断工具。